El Consejo de Facultad es la máxima autoridad colegiada del gobierno de cada Facultad. En él participan el decano, directores de los departamento y programas académicos. También lo conforman estudiantes de pregrado y posgrados, profesores de planta y cátedra que son elegidos por sus pares para un período de dos años. Se suman a ellos los egresados que son designados directamente por el Consejo de cada Facultad.